Platforma HaeR² udostępnia funkcjonalności rozliczeń z Zakładem Ubezpieczeń Społecznych w zakresie rozliczeń składek ubezpieczeniowych i rejestracji ubezpieczonych oraz z Urzędem Skarbowym w zakresie rozliczeń podatków oraz PIT.

W zakresie ZUS rozliczenia odbywają się za pośrednictwem systemu Płatnik. System generuje automatycznie pliki XML, które są wczytywane do systemu Płatnik. Pliki rozliczeniowe związane są z comiesięcznym rozliczaniem składek ZUS oraz z rejestracją, wyrejestrowaniem pracowników w ZUS, zmianą danych, rejestracją ubezpieczeń dla członków rodziny.

W zakresie rozliczeń US, system nalicza i pobiera comiesięczną zaliczkę na podatek dochodowy, a także w trybie rocznym rozlicza PIT4R oraz PIT11. System wymienia z US dokumenty poprzez elektroniczną bramkę udostępnianą przez US podpisane kluczem elektronicznym.